Przedmiotem badań hydrogeologii jest najważniejszy i najpowszechniej używany surowiec mineralny – woda. Decyduje ona o istnieniu, trwaniu i rozwoju życia we wszystkich jego formach. Woda znajduje się w ciągłym ruchu wywołanym przez energię słoneczną i siłę grawitacji. Krąży między oceanem, powietrzem i lądem w złożonym i nieprzerwanym cyklu. Jej ilość jest stała. 
 

Państwowy Instytut Geologiczny skupia swą uwagę głównie wokół wód podziemnych. Są to wody znajdujące się pod powierzchnią terenu, wypełniające pory i szczeliny skał skorupy ziemskiej. Wody te jak i procesy wzajemnego oddziaływania wód podziemnych i środowiska geologicznego, w którym występują, bada hydrogeologia (z gr. hydor – woda, ge – Ziemia, logos – nauka). Z uwagi na wspólne metody badawcze oraz miejsce występowania wód podziemnych, hydrogeologia jest traktowana jako jedna z dziedzin geologii.

Pracownia hydrogeologii w Oddziale Geologii Morza Państwowego Instytutu Geologicznego istnieje od 1986 roku. Pierwotnie do jej zadań należały prace związane z monitorowaniem stanów i jakości zwykłych wód podziemnych w regionie gdańskim. Z czasem zakres prowadzonych prac został znacznie poszerzony.